Všechna semena by měla být skladována na chladném a suchém místě, chráněná před hlodavci a skladovými škůdci.
Komerční obilí se obvykle prodá do jednoho až dvou let. Pokud je vlhkost obilí 12 % a méně, lze je obvykle skladovat v nevytápěných skladech bez obav z poškození zimními mrazy. Je třeba dbát na to, aby pytle nenasály vlhkost z podlahy ani jiným způsobem. Některé fumiganty snižují klíčivost semen. Přepravní palety jsou vhodné pro stohování a zvedání pytlů se semeny vysokozdvižným vozíkem. Poměrně jednoduchá klimatizace dokáže snižovat teplotu a regulovat vlhkost, přičemž udržuje utěsněný a dobře izolovaný sklad s relativní vlhkostí 55 % a teplotou 10 °C.
Semena rodičovských inbredních linií a jednoduchých hybridů určených k výsevu na semenná pole musí být někdy skladována po dobu 5 a více let, aby bylo možné efektivně využít jejich zásoby. Dlouhodobé skladování chovného materiálu vyžaduje speciální zpracování.
Sayre publikoval výsledky rozsáhlých experimentů o skladování kukuřičného osiva. Některé Sayrovy experimenty se od ostatních liší tím, že semena byla hermeticky uzavřena ve skleněných zkumavkách nebo plechových krabičkách. Semena uložená na vzduchu mohou absorbovat nebo uvolňovat vlhkost v závislosti na relativní suchosti vzduchu.
Sayre skladovala semena při různých teplotách. Jejich klíčivost se každoročně zjišťovala výsevem do půdy v normálních časech. Studoval vliv vlhkosti semen a skladovací teploty na klíčení semen kukuřice skladovaných po různou dobu. Semena s vlhkostí 18 % uhynula po roce až dvou. Při 14% vlhkosti byl pozorován pokles klíčivosti, což by po 3-4 letech mohlo velmi zhoršit kvalitu setí semen. Semena s vlhkostí 7,5-11% vyklíčila celkem uspokojivě po 7 letech. Klíčivost semen s vlhkostí 5 % byla po 80 letech skladování 13 %.
Klíčení semen kukuřice s vlhkostí 11,2 %, skladovaných za různých podmínek. Semena skladovaná při vyšších teplotách se po několika letech stala nevhodná k setí. Klíčivost stejných semen, ale skladovaných při nízkých teplotách, se nesnížila ani po 12 letech skladování. Semena skladovaná v otevřených zkumavkách při 3 °C neklíčila dobře, protože ve vlhkém skladování absorbovala vlhkost ze vzduchu.
Sayre dospěl k závěru, že semena kukuřice skladovaná za příznivých podmínek v uzavřených skleněných zkumavkách zůstala životaschopná déle než semena skladovaná za stejných podmínek, ale vystavená vzduchu. Semena kukuřice s obsahem vlhkosti nad 12 % rychle ztratila životaschopnost bez ohledu na jiné podmínky skladování. Nižší vlhkost podporovala životnost semen. Skladování při teplotě 21 °C nebo vyšší mělo negativní vliv na životnost semen, zatímco skladování při teplotě zmrazování nebo nižší mělo vždy pozitivní vliv.
Semena vysušená na obsah vlhkosti 5-8 %, uzavřená ve vzduchem naplněných zkumavkách a skladovaná při 21 °C nebo nižší zůstala životaschopná po dobu 13 let a zjevně mohla zůstat životaschopná mnohem déle. Skladování v atmosféře oxidu uhličitého nebo dusíku mělo malý vliv na trvanlivost, ale snižovala se při skladování v atmosféře kyslíku. Vzduchotěsné nádoby prodlužují životnost semen tím, že zabraňují kolísání jejich vlhkosti při změnách vlhkosti vzduchu. Osivo lze skladovat několik let tak, že se suší na 5-8% vlhkost a umístí se do uzavřených nádob. Měl by být skladován při stálé teplotě.
Pokud lze semena skladovat v suchu a chladu, zůstanou životaschopná po mnoho let.
Podle Bockholta a kol. byla po 22 letech skladování v chladničce klíčivost semen kukuřice 34 %.
Bass uvedl, že pro bezpečné dlouhodobé skladování semen jsou nezbytné řízené atmosférické podmínky. Teplota a relativní vlhkost vzduchu hrají rozhodující roli při regulaci vlhkosti semen v otevřeném skladu. Skladování je výhodné při teplotách mezi +5 a -29 °C, ale mnoho odrůd semen je nejlepší skladovat při teplotách pod -18 °C. Při vyšších teplotách by měla být vlhkost semen pečlivě kontrolována úpravou relativní vlhkosti při skladování nebo sušením. semena a jejich skladování v nádobách odolných proti vlhkosti. Kovové, skleněné a vícevrstvé měkké obalové materiály, včetně vrstev fólie o tloušťce 0,00035 palce, jsou při správném utěsnění nepropustné pro vodní páru. Poměrně dobře vysušená semena (do obsahu vlhkosti 2–7 %), uzavřená ve vodotěsných nádobách, lze bezpečně skladovat několik let při normální pokojové teplotě (21–32 °C) a mnohem déle při nízkých teplotách (od + 5 až -29 °C). Snížení skladovací teploty o každých 5,6 °C zdvojnásobuje dobu životaschopnosti semen. Skladování v částečném vakuu nebo v atmosféře jakéhokoli plynu (CO2, O2, N2 atd.) může buď prodloužit nebo zkrátit životaschopnost semen.
Cotton uvažoval o hubení škůdců při skladování semen kukuřice. Poukázal na to, že většina hmyzu, který poškozuje semena ve skladech, pochází z tropů nebo subtropů a ke svému prospívání vyžaduje teplé klima. V boji proti hmyzu se používají hygienická opatření, fumigace, naftalen a paradichlorbenzen, prachy na opylování semen kukuřice a sáčky odolné proti hmyzu.
